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快速入门指南

1. 数据库概述

我们的数据库包含三个主要部分:

  • 次生代谢物: 由生物体产生的化合物
  • 小肽: 氨基酸短链
  • 小RNA: 小RNA分子

2. 搜索功能

每个部分都提供:

  • 高级搜索功能
  • 可排序列
  • 分页(每页15项)

3. 数据显示

所有数据表都包括:

  • 可排序列(点击列标题)
  • 用于过滤结果的搜索框
  • 页面导航控件
  • 适用于所有设备的响应式设计

常见问题

如何搜索特定数据?

使用任何数据表顶部的搜索框。您可以输入相关字符进行搜索。

Search box screenshot
如何对数据进行排序?

点击任何列标题以按该列排序。再次点击以反转排序顺序。

如何在页面之间导航?

使用每个表格底部的分页控件在结果页面之间移动。

不同的证据类型是什么意思?

有三种证据类型:

  • E: 代表实验数据(Experimental)
  • D: 代表来源于GNDC数据库
  • G: 代表基因组解析
如何使用分析工具?

工具页面提供三个分析模块:

  • 化合物相似性分析:

    输入SMILES字符串,选择指纹类型(Morgan、RDKit、MACCS、原子对或拓扑扭转)和相似性方法(Tanimoto、Dice、Cosine、Sokal或Russel)。该工具将计算与数据库中所有化合物的相似性分数,并显示最佳匹配及其结构。

    Compound Similarity Analysis screenshot
  • 肽性质分析:

    使用单字母氨基酸代码(A-Z)输入肽序列。该工具将计算各种性质,包括分子量、Atchley因子、Kidera因子、疏水性、等电点和净电荷。结果以表格和雷达图的形式显示,类似于肽详情页面。

    Peptide Property Analysis screenshot
  • RNA二级结构预测:

    输入RNA序列(A, C, G, U)。该工具使用ViennaRNA预测二级结构,并通过交互式可视化显示。结构以点括号表示法和2D结构图的形式显示。

    RNA Structure Prediction screenshot